Ａ. 佛學篇：
1. 如來藏 如來藏大乘佛教術語。 最貼切之註解：「如來藏乃法身在纏。」，即此義，故知眾生都有成佛的可能性。大乘佛教三大派別（中觀、唯識、如來藏）之一。如來藏遍一切處，遍一切時，遍一切地，遍一切界，遍一切法。遍一切處，就是十二處六根六塵處，眼根觸色塵處有如來藏的顯現，耳根觸聲塵處有如來藏的顯現，鼻…舌….身….，意….。六根六塵都是如來藏變現出來的，都有如來藏的執持作用，眾生所接觸的每一個境界都是如來藏所顯現出來的。
如來藏遍一切時，從出生到死亡，到中陰身，到胚胎，到再一次出生，如來藏就從來沒有斷滅過，每一剎那都在執持著眾生色身的生命活動，眾生的生老病死都由於祂的運作而出現，當然包括業力。只要是世間存在的法，不管眾生有沒有努力認知到，都是由如來藏所生所顯現，需要理解“存在與顯現”的問題。如果行者修如來藏就是修“存在與顯現”，因為觀修如來藏修法的時候就是用“存在與顯現”來修。
2. 唯識學 唯識學是研究心識變化和作用的一門精神科學，它以「唯識無境」為一貫之道來說明宇宙人生的現象和本質都不離心識而有。我們主體是由五藴和合而成，即色、受、想、行和識；唯識學包含‘八識’，即眼識、耳識、鼻識、舌識、身識、意識、末那識和第八識阿賴耶識，第七識生起自我，帶有我執作用；而第八識含藏著淨染萬法種子，世世代代因作業而生，能夠牽引主體克應相關業報。由此看到笛卡兒所提出的“考慮自我”，可被認為基於第七識，第八識之不滅，與量子細胞包含之記錄，能夠理解成心理學所說的潛意識，牽引主體，作出往後各式各樣的行為。緣起現象是講業果唯識的道理，空性本質是明清淨法界的原理。「業」究竟是什麼？造業的時候，一定與「識」有關係，也就是第六識，又稱「分別識」，亦即自己知道有動作，分別、曉得這是善的、惡的，這是好的、不好 的，這是我喜歡的、我不喜歡的。前五識沒有這種功能，只是覺知，譬如從身體知道有痛、癢，從眼睛看到每一樣東西，但是沒有什麼好壞或討厭不討厭的感受，在 這種狀況下，不會構成業的力量，因此，要構成業的力量，一定是經過第六識。
構成業以後，在這一生之中，可能會得到果報，亦即現世報——造了什麼樣的因，就得到什麼樣的果。所以犯罪的人，往往在這一生便可能會受到司法的審判而 坐牢；做了好事的人，則有可能受到表揚，受到許多人的歌頌、讚歎，這是一生之中的因果。至於來生之後的果報，即是因為我們現在所造的業到了第八識。所以， 現生的果報是第六識製造，第六識接受，但是未來的果報，則是貯存在第八識。第八識又稱「藏識」，貯藏業力。這一生業的力量存在第八識裡，死後就到下一生去 接受另外的果報。
人從這一生到下一生中，只有一樣東西存在—第八識，這在人的生命之中、真正活著的時候，當然也是存在的，因此，構成生命的條件有三項：壽、煖、識。壽 是壽命，也就是說，在時間裡，有其生命的意義在；煖則是身體有暖氣存在的時候，這也是生命。死亡的時候，首先是煖離開，然後是壽，最後才是第八識離開。第八識離開，便是要接受之後的果報。然而，這是指凡夫，聖人則沒有第八識，我們修行就是要轉第八識成智慧。
B. 科學篇：
1. 不確定性原理(uncertainty principle) 海森堡不確定性原理準確的來說，就是微觀粒子的動量和位置（或能量和時間）不能同時測量到。我們知道，越想測量微觀粒子的位置精確度，就越要用波長短的電磁波去探測，而波長越短，頻率就越大，動量就越大，自然對探測對象的擾動就越大，我們越想更精確的測量粒子的位置，其粒子的動量就越不精確。所以當我們對事物的某一面觀察更細緻時，對另一面的觀察就越不細緻。當我們同時觀察事物的兩面時，對每一面的觀察程度都不如單獨觀察這一面時細緻。
粒子本身就是同時處於兩種疊加狀態，也就是位置與動量（時間與能量），似乎這樣的概念比較抽象，也就是一些關於過去與時間-能量相關與不確定性結連的困難。 然而可以看到盤古初開時，系統和環境與時間無關的量子復合，時間-能量不確定性不僅可以在經典環境的情況下得出與系統的關係，亦提供一個用來監視量子系統的經典時鐘。
ΔEΔt≥ℏ/2
假使一粒粒子它的生命（lifetime Δt）是非常短的，很快就衰變成其他短命粒子，同時因為不確定理論，他的能量ΔE將會分佈成比較寛闊的能量階（連續電磁波譜）。
2. 量子糾纏（quantum entanglement） 在量子力學裏，當幾個粒子在彼此交互作用後，由於各個粒子所擁有的特性已綜合成為整體性質，無法單獨描述各個粒子的性質，只能描述整體系統的性質，則稱這現象為量子纏結或量子糾纏。量子糾纏是一種純粹發生於量子系統的現象：對於兩個相互糾纏Ａ和Ｂ粒子分別測量其物理性質，舉例：位置、動量、自旋、偏振等，則會發現量子關聯現象，即是說Ａ是正自旋，Ｂ是負自旋。反之當Ａ變成負自旋，Ｂ會是正自旋。
3. “弦論”（String Theory） 弦論是用一段段「能量弦線」作最基本單位以說明宇宙裡所有微觀粒子如電子、夸克、微中子都由這一維的「能量線」所組成；換而言之，弦論主張「弦」以不同的振動模式對應到自然界的各種基本粒子。“弦論”等於機率，即是某段範圍找到粒子的概率。“弦論”企圖將愛因斯坦“統一場論”中的問題解決。用相對論的原理建立一個力場，如果把粒子和波都統一起來，E=MC^2，這質量(M)與能量(E)就可以統一起來了，能量＝波、質量＝粒子。
4. 全息學（Holography） 全息原來是研究人的大腦，我們把大腦分成一片片，每一片都有它的特殊功能，可是全息呢，就說，大腦裡邊的一個細胞都有整個大腦的功能（註１）。現在已經開始有人擴展全息的理論，就是說每一個個體都可以周遍法界的空間（註２），甚至整個宇宙。
全息，跟佛家的理論，特別是如來藏思想，完全相同。霍金首先提出一個弦論，一條弦在震動，先出現的是能量，這個能量有可能變成質量，是根據機率來變的，有些能，有些不能（註３）。到底有多少轉換為品質要根據機率。那麼我們首先要研究的是能量變成質量的機率，把這個研究清楚了，我們就可以建立一個統一的場，把能量場與質量場統一起來。這個能量等於我們講的如來法身功德，他的機率就是我們的相礙了，能夠適應相礙我們就成為質量。（“礙”是局限，是條件，一切生命、一切世界都要適應它的局限、適應它的條件才能成為“有＝１”，否則成為“無＝０”。）我們們都是質量，都是物質，因為我們們都能適應那個相礙。如果不能適應就不能成為物質了。所以他的弦論，由弦的震動，根據機率來成立物質世界，這幾乎就是用如來藏思想來思考了。佛家的哲學是到目前為止的所有物理學都沒法子推翻的，沒有矛盾。
（註１）「大腦裡邊的一個細胞都有整個大腦的功能」：大腦裡邊每一個細胞都由量子組成，量子的工作原理與量子電腦一致，它有三種意識資訊，我們稱之為“量子比特”（qubits，量子資訊的基本計量單位，可以以＂1 ＂、＂0”和不確定“又0又1”的狀態存在）。一位數學物理學家羅傑·彭羅斯（Roger Penrose）聲稱意識是神經元細胞微管中量子引力效應的結果。不同的量子比特通過量子糾纏（entanglement）的方式連接起來。
（註２）「每一個個體都可以周遍法界的空間」：生命創造宇宙，有個人意識才有宇宙的存在，實質上的生命與生物是真實世界的中心，接著才有宇宙，宇宙本身並不會創造生命；意識使得世界變得有意義，時間與空間只是人類意識的工具。
（註３）「能量有可能變成質量，是根據機率來變的，有些能，有些不能」：粒子（量子）可以用多個波函數疊加而成，身體既可視為很多粒子組成，也可視為許多波函數疊加而產生。波函數是用機率描述其存在，量子糾纏處於一種非常脆弱的狀態，周圍環境中任何一絲輕微的擾動（被觀察或動念）都可能使其消失無蹤：哪怕只有一個光子無意中撞上了一個量子比特，整個量子糾纏就會因為發生坍縮而分崩離析，徹底摧毀整個系統的量子特性。但有些量子資訊以量子比特的形式，可以儲存足夠長的時間，大腦一定需要一些其他的特殊機制———比如多個量子比特間的糾纏機制，以及將這種糾纏體現到神經衝動上的化學機制。此外，在大腦中傳輸以量子比特形式存儲的量子資訊，也需要一定的機制來實現。
C. 解釋篇：
全息(B.4)如果跟霍金的弦論(B.3)配合，我們可以看到在這個世界裡，整個宇宙起源於一個大爆炸，短時間將不同能量的粒子（弦絲）聚合或分裂而形成最原始的物質，而每一點包含整體的特性，這就是稱為全息宇宙論（Holographic Universe Principle）；此外我們其實並不是一個個體，我們的身是周遍法界的，不過顯現出來就是我們們這樣一個身，當然科學家不能解釋這現象。宇宙周遍(A.1)，佛周遍，我們也周遍，這才是絕對的大平等。所以我們修道的理論，修止觀的理論，漸漸得到科學上的證明，寧瑪派所傳的教法的的確確是法界的真實。把本尊擴大到整個法界用光明來擴大，可以說光明中每一點都是我們的法身，我們不要以為我們不是佛就沒有法身，只不過我們的法身被障蓋住而已，我們不認識這個法身。因此我們的修道我們的止觀有相無相，其實就是看我們施設不施設。我們施設到什麼程度，我們的自我(A.2)就大到什麼程度。
重提“存在與顯現”，根據(B.4註3)，身體既可視為很多粒子（弦絲B.3）組成，也可視為許多波函數疊加而產生。日常生活中，我們被觀察或動念，顯現成肉身，「業」（Karma）(A.1)是一種行為，任何心理動作、生理動作或者是物理動作，只要有動作，就叫作「業」。這些動作與我們的心念、意 識不相應或沒有關係，那就不能構成業，因此「業」與「識」一定是連在一起的(B.2)，所以，只要業動，我們的識便會跟著改變，業不動，我們的識也就沒有影響。這與量子糾纏定律有相同的地方。
在現世中，業貯存在第八識（A.2），造成業報，從出生到死亡，到中陰身，到胚胎，到再一次出生，如來藏就從來沒有斷滅過；肉身變成許多波函數疊加一起，在宇宙游離，機緣巧合，游到胚胎，顯現肉身，重複又重複。它能持續一段很長的時間（根據Ｂ.1：Δt很大），皆因產生時能量接近固定（ΔE接近0)，所以不同業力產生不同業報，如是因造成如是果，世世代代，不斷存在與顯現…..
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